Sur mon CR-V 3 phase 2, je laisse mon porte-charge toute l'année. Celà ne me dérange pas car je fais très peu d'autoroute...
Mais c'est plus bruyant c'est clair, surtout à partir d'une certaine vitesse (~80 km/h)
Tu entends clairement des bruits aéros sur le mien sans toit pano alors j'imagine qu'avec...
D'un autre côté je n'ai jamais fait de route avec les barres seules, mais avec les barres + portes skis, trop chiants à démonter. 
En fait, on entend clairement un sifflement aux alentours de 70-80km/h avec les barres ... mais à vitesse autoroutière (120km/h), on ne l'entend quasi plus, enfin c'est très probablement couvert par les autres bruits aérodynamiques.
Bref, ce n'est pas dérangeant de rouler sur l'autoroute avec les barres ... même avec le toit vitré non occulté.